⑴ 如何查找基因序列分析軟體
第1步名單上的必要和最重要的屬性,您在基因序列分析軟體需要。您可能需要一個方案最好的基因序列比較,基因序列的方法或軟體,易於使用的最佳。
第3步該網站的搜索基因編碼,並審查其「Sequencher」軟體程序。這是DNA分析軟體。閱讀在現場的描述,看看這是您需要的最佳方案。
第4步訪問該網站DNAstar.com和閱讀有關的基因分析產品。這家公司提供了「序列分析的計算機軟體」和「序列組裝」。您可以要求報價線上。
⑵ 如何在基因組序列中查找目的基因
一:先要知道你要的是什麼基因,也就是什麼部位的,如線粒體里的等等
二:調取近緣種相關基因的序列。
三:在NCBI里做一個BLAST。
四:選取所要基因的保守序列。
五:在BioEdit生物分析軟體里查找所需的DNA序列即可!!!
⑶ 跪求DNA分析軟體:CodonCode Aligner 使用說明,教程,越詳細越好,萬分感謝。十萬火急,實驗急用,在這先
如果實驗急用,先到這個網頁,做序列比對吧
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=megaBlast&BLAST_SPEC=blast2seq
⑷ 在NCBI上怎麼找到一個基因的外顯子和內含子
事實上,在NCBI有很多種辦法可以確定某個基因的外顯子或者內含子,當然還有UTR區域。今天我們來介紹NCBI的其中一個使用軟體Splign來在NCBI上找到一個基因的外顯子和內含子。操作步驟如下:
1.在Gene資料庫,填入基因名HNF-4,我一般的話習慣叫Symbol,每個基因都有個Symbol,即基因名。
⑸ 如何使用ncbi查找某一基因的dna序列
打開NCBI的首頁,在下拉菜單中選中gene,輸入你需要找的基因的名稱,點擊搜索就可以了
⑹ 怎麼樣用MEGA軟體分析DNA序列
當查詢到一系列需要比對的序列後,先用ClustalX軟體進行序列校正,生成.aln文件。然後在MEGA軟體功能下將.aln文件轉換為.meg文件。即可對該文件進行系統樹構建等操作了。
⑺ 如何用dnaman軟體設計引物及找到引物上的酶切位點
1)PCR 引物設計
首先,將目標 DNA 片段裝入 Channel,並激活 Channel。點擊主菜單欄中的 Primer 主菜
單,出現下
拉菜單,如下所示:
點擊 Design PCR Primers for DNA 命令,出現下列對話框: 參數說明如下:
Primer locations on target 引物定位
其中包括下列選項:
Proct size(擴增目的片段大小)
Sense primer (正向引物選擇區)
Antisense primer(反向引物選擇區)
Primer 引物特性包括 Length(引物長度),Tm 值, GC 含量等參數;
Reject primer 引物過濾(將符合引物過濾條件的引物過濾掉)
包括下列選項:
3』dimer(可形成 3』端自我互補的鹼基數)
Hairpin stem(可形成發卡頸環結構的鹼基數)PolyN(多聚鹼基)
3』Uique(3』端嚴格配對鹼基數)
Primer-Primer(含義未知)
All matches(引物互補配對百分數)
Consentrations 濃度設定
Proct for hybridyzat(ion) PCR 產物用於 Southern Blot 探針雜交
點擊按鈕,出現下列對話框:
.選擇需要的選項,點擊按鈕,出現:
點擊按鈕,完成操作。
2)DNA 序列的限制性酶切位點分析
將待分析的序列裝入 Channel,點擊要分析的 Channel,然後通過 Restriction/Analysis
命令打開對
話框,如下所示:
參數說明如下:
Results 分析結果顯示
其中包括:
Show summary(顯示概要) Show sites on sequence(在結果中顯示酶切位點)
Draw restriction map(顯示限制性酶切圖)Draw restriction pattern(顯示限制性酶
切模式圖)
Ignore enzymes with more than(忽略大於某設定值的酶切位點)
Ignore enzymes with less than(忽略小於某設定值的酶切位點)
Target DNA (目標 DNA 特性)
circular(環型 DNA),dam/dcm methylation(dam/dcm 甲基化)
all DNA in Sequence Channel(選擇此項,在 Sequence Channel 中的所有序列將被
分析,如果
選擇了 Draw restriction pattern,那麼當所有的 channel 中共有兩條 DNA 時,則只能選擇兩個酶
分析,如果共有三個以上 DNA 時,則只能用一個酶分析。
選擇所需的項目,然後按提示操作點擊按扭,出現下列對話框:
參數說明如下:
Enzyme
代表(enzyme data file),點擊旁邊的下拉按鈕,出現兩個默認選項,restrict.enz 和
dnamane.enz,
如果添加過自製的酶列表,則附加顯示自製酶列表文件名。其中 restrict.enz 數據文件包
含 180 種
限制酶,dnamane.enz 數據文件包含 2524 種限制酶。選擇其中一個數據文件,相應的
酶在左邊的
顯示框中列出(按酶名稱字母表順序),滑鼠雙擊酶名稱,則對應的酶被選中,在右邊空白
框中列
出。要自製酶切列表,可以從左邊酶列表中雙擊滑鼠選擇多種酶(例如 puc18 multiple
cloning sites),
然後點擊按鈕出現下列對話框:
輸入要保存酶列表的文件名,點擊按鈕即可保存。自製酶列表可以方便分析特定的酶切
位點。
Cutter 酶切識別序列長度;End 酶切產生的末端,其中包括,Blunt(平頭末端),
5』Overhang
(5』突出粘性末端),3』Overhang(3』突出粘性末端),系統根據 cutter 和 end 的設定情
況,在左邊酶列表
中顯示符合條件的酶。最後,點擊按鈕執行操作。
⑻ 歐宗瑛的出版著作和論文
★ 計算機輔助設計,統編教材,機械工業出版社 1994
★ 機械設計手冊(第二版)計算機輔助設計篇,機械工業出版社98頁22萬字,主編(全國科技圖書二等獎,1995)
★ 機械工程手冊(第二版)計算機輔助設計篇,機械工業出版社1996年14萬字,主編
★ CAD/CAM技術,高教機電類規劃教材,機械工業出版社,7.4萬字,副主編(2002全國高校優秀教材二等獎) (包括與指導的研究生合作)(其中EI檢索66篇;SCI檢索10篇):
1.Ou,Zongying; Tang,Xusheng; Su,Tieming; Zhao,Pengfei,Cascade AdaBoost classifiers with stage optimization for face detection,Lecture Notes in Computer Science,v 3832 LNCS,Advances in Biometrics - International Conference,ICB 2006,Proceedings,2006,p121-128(SCI、EI收錄)
2.Tang,Xusheng; Ou,Zongying; Su,Tieming; Zhao,Pengfei,Cascade AdaBoost classifiers with stage features optimization for cellular phone embedded face detection system,Lecture Notes in Computer Science,v 3612,n PART Ⅲ,Advances in Natural Computation: First International Conference,ICNC 2005. Proceedings,2005,p688-697(SCI、EI收錄)
3.Tang,Xusheng; Ou,Zongying; Su,Tieming; Sun,Haibo; Zhao,Pengfei,Robust precise eye location by adaboost and SVM techniques,Lecture Notes in Computer Science,v 3497,n Ⅱ,Advances in Neural Networks - ISSN 2005: Second International Symposium on Neural Networks. Proceedings,2005,p 93-98(SCI、EI收錄)
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5.Li,Yunfeng; Ou,Zongying; Wang,Guoqiang,Face recognition using Gabor features and Support Vector Machines,Lecture Notes in Computer Science,v 3611,n PART Ⅱ,Advances in Natural Computation: First International Conference,ICNC 2005. Proceedings,2005,p119-122(SCI、EI收錄)
6.Hua,Shungang; Zhang,Jing; Ou,Zongying,Novel view generation from two reference images based on the same optical axis,The Fourth International Conference on Computer and Information Technology (CIT 2004),2004,p801-806(EI收錄)
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王亮申; 歐宗瑛,圖像紋理分析的灰度-基元共生矩陣法,計算機工程,2004(23)(EI收錄)
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15.華順剛; 逄嶺; 歐宗瑛,特徵點提取及視圖變形技術研究,大連理工大學學報,2004⑸(EI收錄)
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17.張恆博; 歐宗瑛,一種基於色彩和灰度直方圖的圖像檢索方法,計算機工程,2004⑽(EI收錄)
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20.唐棣; 孫岩; 韓麗; 歐宗瑛,一種基於顯示空間的圓窗口的圖形裁剪演算法,小型微型計算機系統,2004⑷
21.張恆博; 歐宗瑛,一種改進的掃描線真實感圖形顯示演算法,計算機工程,2004⑹
22.張恆博; 歐宗瑛,一種利用多特徵向量的彩色圖像檢索方法,計算機工程與應用,2004⑵
23.李暉; 歐宗瑛,異構分布環境下數據獲取與多態發布,計算機工程與設計,2004⑴
24.王宏漫; 歐宗瑛,基於支持向量機的人臉識別方法研究,小型微型計算機系統,2004⑴
25.柴玉森; 歐宗瑛; 韓風武; 陸培德; 韓鋒,基於CAPP的模具報價系統的開發,模具工業,2004⑴
26.韓峰; 張靜; 歐宗瑛,基於攝像機縱向運動的序列圖像的實時漫遊,小型微型計算機系統,2005⑽
27.劉文琦; 楊建華; 張鵬; 歐宗瑛,一種基於橢圓曲線的門限代理簽名方案,大連理工大學學報,2005⑹(EI收錄)
28.袁野; 歐宗瑛,一種基於單個神經元的攝像機標定自適應演算法,大連理工大學學報,2005⑹(EI收錄)
29.何洋; 歐宗瑛,基於局部細節鄰接圖的指紋匹配演算法研究,哈爾濱工業大學學報,2005⑽(EI收錄)
30.宋濤; 歐宗瑛; 陳偉卿,基於模糊連通性的彩色圖像切片序列分割方法,小型微型計算機系統,2005⑼
31.王亮申; 朱玉才; 陳少華; 侯傑; 於京諾; 蘇子林; 歐宗瑛,利用SVM進行車型識別,計算機工程與設計,2005⑼
32.胡志萍; 歐宗瑛; 王虹,基於圖像合成的虛擬製造環境描述,機械設計與研究,2005⑷
33.李雲峰; 歐宗瑛,基於相位信息的圖像特徵定位,光電技術應用,2005⑸
34.韓鋒; 蘇鐵明; 歐宗瑛; 羅丹,SolidWorks環境下三維沖模標准件庫的開發,大連輕工業學院學報,2005⑶
35.宋濤; 歐宗瑛; 王瑜; 李冠華; 劉斌,八叉樹編碼體數據的快速體繪制演算法,計算機輔助設計與圖形學學報,2005⑼(EI收錄)
36.王亮申; 歐宗瑛; 侯傑; 於京諾; 朱玉才; 曲衍國; 王保衛; 宋進桂,基於遺傳演算法的最優直方圖閾值圖像分割演算法,數據採集與處理,2005⑵(EI收錄)
37.張靜; 胡志萍; 歐宗瑛,基於異常匹配點去除的基本矩陣優化估計,計算機工程,2005⒀(EI收錄)
38.王亮申; 歐宗瑛; 侯傑; 於京諾; 曲衍國; 宋進桂; 朱玉才,基於金字塔結構顏色特徵的圖像資料庫檢索,計算機工程與設計,2005⑷
39.王亮申; 於京諾; 侯傑; 歐宗瑛; 朱玉才; 陳燕,目標形狀特徵的新定義,計算機工程與應用,2005⒄
40.宋濤; 歐宗瑛; 陳偉卿,中國虛擬人三維模型重建和可視化,大連理工大學學報,2005⑶(EI收錄)
41.華順剛; 張潔玉; 歐宗瑛,基於圖像的光照,計算機工程與設計,2005⑶
158.王亮申; 歐宗瑛; 朱玉才; 侯傑; 於京諾,基於SVM的圖像分類,計算機應用與軟體,2005⑸
42.胡延平; 馬德成; 何鴻鵬; 歐宗瑛,基於模型重建技術的圖形匹配原理與方法,大連理工大學學報,2005⑵(EI收錄)
43.王宏漫; 歐宗瑛; 胡志萍,自由差分運算與直交型Snake模型,計算機輔助設計與圖形學學報,2005⑶(EI收錄)
44.張靜; 胡志萍; 劉志泰; 歐宗瑛,基於輪廓相位相關的圖像自動拼接,大連理工大學學報,2005⑴(EI收錄)
45.郭浩; 歐宗瑛; 何洋,一個新的基於細節特徵的指紋匹配方法,大連理工大學學報,2005⑴(EI收錄)
46.魏鴻磊; 歐宗瑛; 甘樹坤; 張海東,採用逐級配准和分值加權的指紋匹配演算法,計算機輔助設計與圖形學學報,2006⑹(EI收錄)
47.胡志萍; 郭明恩; 歐宗瑛,一種基於圖像輪廓信息的新視點圖像生成算,大連理工大學學報,2006⑶
48.侯建華; 歐宗瑛,基於邊緣曲線光順連續性恢復的灰度圖像放大演算法,小型微型計算機系統,2006⑷
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93. 沖模CAD系統中基於功能部件的層次化裝配模型和相關技術研究. 模具工業. 2002⑹
94. 進化演算法在DNA序列比對中的應用. 數據採集與處理. 2002⑷
95. 關於核苷酸序列頻譜分析方法的探討. 信號處理. 2002⑷
96. 一種新的DNA序列映射規則及其分析應用. 信號處理. 2002⑵
97. 基於BP網路的足球機器人視覺系統的標定. 機器人. 2001(S1)
98. 面向企業應用的密鑰管理技術研究. 計算機工程與設計. 2001⑹
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101. 多葉光柵適形放射治療系統圖像圖形處理軟體研究與開發. 大連理工大學學報. 2001⑹
102. 體素幾何模型中物體表面的繪制演算法. 機械科學與技術. 2001⑹ (EI收錄)
103. Dividing Cubes演算法生成的物體表面的法向量方向的光順操作. 計算機輔助設計與圖形學學報. 2001⑿ (EI收錄)
104. 一種新的攝像機線性標定方法. 中國圖像圖形學報. 2001⑻
105. 基於投影的斷層間多連通物體輪廓表面重建. 大連理工大學學報. 2001⑸ (EI收錄)
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117. 基於B-rep模型的三維實體的真實感顯示. 機械科學與技術. 2001⑵(EI收錄)
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133. 利用加密技術和網卡進行軟體保護. 計算機應用. 2000(01)
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136. 基於個人特徵的省份認證技術的發展與應用. 計算機工程. 2000⑿
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145. 網路環境下工程圖紙的「電子簽字」技術. 組合機床與自動化加工技術. 1999⑼
146. Windows95/NT下加密和數字簽名的開發與應用. 通信保密. 1999⑷
147. 工程掃描圖像的直線整體識別演算法. 中國圖像圖形學報. 1998⑾
148. 基於分形幾何模型的圖像放大. 中國圖像圖形學報. 1998⑾
149. 二維參數化CAD中的過約束及欠約束檢查策略與實現. 大連理工大學學報. 1998⑸(EI收錄)
150. 手繪CAD圖形輸入的識別. 機械科學與技術.V17.No.2. 1998.3(EI收錄)
151. 彩色印染圖像的新的分組分段色分解技術. 計算機應用研究. 1998⑴
152. 消防建築圖紙的審核管理. 計算機應用. 1998⑵
153. 彩色圖像顏色量化的優化. 大連理工大學學報. 1998⑴(EI收錄)
154. 網路環境下軸承CAD系統的開發. 計算機應用研究. 1998
155. 聯機手繪CAD圖形的輸入. 機械科學與技術. 1998⑵
156. 彩色圖像印染CAD系統. 計算機工程與應用. 1997⑿
157. 數字曲線的線性逼近和分段識別. 大連理工大學學報. 1997⑸
158. 基於多面體的過渡操作. 計算機應用與軟體. 1996⑶
159. 參數化CAD中基於當量圖素的約束處理策略. 大連理工大學學報. 1995⑸
160. 工程圖樣描述語言DDL. 大連理工大學學報. 1995⑸(EI收錄)
161. 實體造型中的回退原理及其應用. 大連理工大學學報. 1995⑸(EI收錄)
162. CAD圖形資料庫中特徵關系和約束關系的自動識別和提取. 計算機工程. 1995⑹
163. 基於ΓOCT21354-87標準的齒輪強度計算軟體的開發. 機械科學與技術. 1995⑸ (EI收錄)
164. 二值和多值圖像的邊界跟蹤和逼近. 大連理工大學學報. V35.No.3. 1995.6 (EI收錄)
165. 基於變異幾何的平面連桿機構分析與模擬專家系統. 大連理工大學學報. 1995⑵
166. 平面連桿機構分析與模擬專家系統. 計算機輔助設計與圖形學學報. 1995⑴ (EI收錄)
⑼ 用DNAMAN軟體怎樣分析一段已知序列屬於哪個基因
如果你已知一些基因的序列,可以用DNAMAN 比對,如果不知道,就要從NCBI上查。
⑽ 測序基因圖軟體請教
思路不對哈。
測序公司給出的測序結果包含兩部分:一是測序結果,二是測序對應的信號波峰,信號主要是反應測序結果的可靠性的。
如上圖所示,信號很好,那就說明測序沒有問題。你可以大膽的進行序列比較,也就是alignment。
我用DNAMAN給你演示一下吧 首先依次點擊file-open special-AB1/SCF trace 打開擴展名為.ab1的測序圖譜,查看沒有問題。
小弟採納我的意見吧,我最近特需要分值,以後有啥問題,記得發問找我呀。